More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0349 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  69.5 
 
 		 493 aa  714    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 527 aa  1091    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 465 aa  352  1e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 470 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 465 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 481 aa  289  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 483 aa  287  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 480 aa  287  4e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 484 aa  287  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 466 aa  286  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 785 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 484 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 466 aa  277  4e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 475 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 470 aa  269  8.999999999999999e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 472 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 465 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 474 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 484 aa  266  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 494 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 489 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 493 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 465 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 465 aa  263  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 465 aa  263  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 465 aa  263  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 465 aa  263  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 465 aa  263  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 465 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 492 aa  262  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 465 aa  262  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 470 aa  261  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 465 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 485 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 467 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 500 aa  257  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 481 aa  256  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 495 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 481 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 499 aa  256  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 478 aa  256  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 485 aa  256  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 465 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 499 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 474 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 486 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 485 aa  251  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 499 aa  251  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 492 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  34.03 
 
 		 497 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 465 aa  249  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  32.05 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 490 aa  247  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 447 aa  248  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2442  cysteinyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 517 aa  247  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 465 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 476 aa  246  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 504 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 488 aa  244  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 460 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>