More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1163 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 460 aa  953    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 470 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 480 aa  372  1e-102  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 785 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 510 aa  358  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 481 aa  348  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 480 aa  345  7e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 484 aa  338  8e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 484 aa  338  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 484 aa  335  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 465 aa  333  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 483 aa  331  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 468 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 466 aa  329  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 468 aa  327  3e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 481 aa  327  4.0000000000000003e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 475 aa  322  7e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 466 aa  316  7e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 484 aa  312  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  38.31 
 
 		 459 aa  309  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 487 aa  309  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 495 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 471 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  36.89 
 
 		 495 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 459 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 485 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 479 aa  302  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 465 aa  299  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 504 aa  299  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 486 aa  296  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 476 aa  293  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 470 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 500 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 485 aa  292  8e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 453 aa  292  8e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 469 aa  292  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 459 aa  292  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 459 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 480 aa  289  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 474 aa  289  7e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 459 aa  289  7e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 455 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 472 aa  288  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 472 aa  287  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 497 aa  286  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 499 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>