More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8442 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  100 
 
 		 459 aa  930    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 785 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 465 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 461 aa  339  7e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 492 aa  327  4.0000000000000003e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 460 aa  323  5e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 484 aa  310  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 457 aa  306  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 484 aa  300  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 465 aa  299  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 465 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 483 aa  296  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 453 aa  296  7e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 484 aa  295  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 481 aa  293  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 485 aa  292  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 459 aa  289  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 462 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 466 aa  285  9e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 457 aa  283  5.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 472 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 475 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 495 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 		 489 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 474 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 459 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 494 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 459 aa  279  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 456 aa  277  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 478 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 490 aa  276  6e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 447 aa  276  8e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 465 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 481 aa  275  9e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 501 aa  273  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 459 aa  273  5.000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 480 aa  273  6e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 469 aa  273  7e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 465 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 497 aa  272  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 465 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 472 aa  272  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 466 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 499 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>