More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5013 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 462 aa  950    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  72.85 
 
 		 465 aa  673    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  73.46 
 
 		 470 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 465 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 460 aa  462  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 461 aa  438  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 785 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 527 aa  353  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 484 aa  316  6e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 484 aa  312  9e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 475 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 495 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 467 aa  305  8.000000000000001e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 472 aa  302  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 459 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 454 aa  299  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 461 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 459 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 461 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 486 aa  296  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 459 aa  295  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 461 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 494 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 480 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 459 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 480 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 459 aa  294  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 459 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 481 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 459 aa  292  7e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 460 aa  292  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 497 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 466 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  35.73 
 
 		 495 aa  290  4e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 466 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 461 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 465 aa  289  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 470 aa  289  9e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 459 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  40.76 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 492 aa  286  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 461 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 492 aa  285  9e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 465 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23530  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 459 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 484 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 500 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 476 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3108  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 466 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00597205  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 472 aa  282  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 493 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>