More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02459 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 457 aa  951    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 470 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 465 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 462 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 460 aa  475  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 492 aa  395  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 785 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 510 aa  349  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 484 aa  325  9e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 480 aa  323  3e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 480 aa  323  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 484 aa  318  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 481 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  38.24 
 
 		 495 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 476 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 481 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 472 aa  302  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 504 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 476 aa  302  9e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 467 aa  296  5e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 466 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 497 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 490 aa  294  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 456 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  38.01 
 
 		 459 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 456 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 499 aa  289  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 489 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 484 aa  286  5.999999999999999e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 500 aa  285  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 465 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 465 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 460 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 481 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 476 aa  282  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 468 aa  282  8.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 460 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13190  cysteinyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 499 aa  281  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.633789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0121  cysteinyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2233  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 501 aa  279  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.056881  normal  0.890291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 459 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 478 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 477 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 460 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 484 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 460 aa  275  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 465 aa  276  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 448 aa  275  9e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 486 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 490 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 478 aa  273  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 458 aa  274  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 461 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>