More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2592 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
785 aa  1595    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
461 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
465 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
465 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
460 aa  372  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
470 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
492 aa  362  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
481 aa  360  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
457 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  43.94 
 
 
459 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
484 aa  349  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
484 aa  349  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
462 aa  348  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
480 aa  346  8.999999999999999e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
483 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
484 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
470 aa  340  9e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
484 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
484 aa  337  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
489 aa  336  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
468 aa  334  3e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
474 aa  334  3e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
475 aa  334  4e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
466 aa  334  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
466 aa  334  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
469 aa  333  7.000000000000001e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
474 aa  333  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
466 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
472 aa  332  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
468 aa  331  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
466 aa  328  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
466 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
477 aa  327  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
472 aa  327  7e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
465 aa  326  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
465 aa  326  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
490 aa  325  2e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
486 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
481 aa  323  7e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
472 aa  323  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
497 aa  323  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
500 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
500 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
468 aa  321  3e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
456 aa  320  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
448 aa  320  6e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
457 aa  320  7e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
492 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
499 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
470 aa  318  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
465 aa  317  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
474 aa  317  5e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
476 aa  317  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
458 aa  317  6e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
465 aa  316  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
465 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
456 aa  316  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
476 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
486 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
465 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
466 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
486 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
466 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
465 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
465 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
465 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
465 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
465 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1181  cysteinyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
493 aa  315  2.9999999999999996e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00250228  hitchhiker  0.0000333718 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
457 aa  313  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
447 aa  313  7.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
467 aa  313  1e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
485 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
480 aa  311  2e-83  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
493 aa  311  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
472 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
470 aa  311  4e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
447 aa  311  4e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
485 aa  311  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
464 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
465 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
504 aa  310  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
457 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
465 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
494 aa  309  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
486 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
478 aa  308  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 
476 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
455 aa  307  5.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
453 aa  307  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
495 aa  306  9.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
461 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
486 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>