More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0164 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 475 aa  987    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1653  cysteinyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 465 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 460 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 466 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 467 aa  361  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 461 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 471 aa  358  8e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 460 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 487 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 472 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 481 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 494 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 460 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 460 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 461 aa  349  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 485 aa  349  5e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 461 aa  349  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 486 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 460 aa  349  8e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 459 aa  348  9e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 465 aa  347  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 460 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 477 aa  346  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 458 aa  346  6e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 459 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 487 aa  343  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 461 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 492 aa  343  5e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 486 aa  342  7e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 459 aa  342  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 478 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 459 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 465 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 476 aa  339  7e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 459 aa  339  8e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 465 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 456 aa  337  3.9999999999999995e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 460 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 460 aa  336  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 494 aa  335  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 478 aa  335  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 489 aa  336  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 465 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 470 aa  335  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 465 aa  335  9e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>