More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6692 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  75.86 
 
 		 470 aa  730    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  72.85 
 
 		 462 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 465 aa  959    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 457 aa  511  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 785 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 527 aa  341  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 480 aa  322  7e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 483 aa  312  9e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 484 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 484 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 472 aa  302  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 459 aa  302  8.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 497 aa  302  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 486 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 495 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 497 aa  295  9e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 467 aa  295  9e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 481 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2485  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 469 aa  289  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8442  Cysteine--tRNA ligase  39.91 
 
 		 459 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 461 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 456 aa  283  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 490 aa  282  9e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 484 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 465 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 468 aa  281  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 504 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 459 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 459 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 468 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 459 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 470 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 459 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 461 aa  279  7e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 465 aa  278  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 489 aa  279  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  35.29 
 
 		 495 aa  278  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 494 aa  277  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 466 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 461 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 481 aa  276  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 460 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 460 aa  275  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  39.75 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 500 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 472 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 465 aa  273  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 460 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 461 aa  272  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 461 aa  272  9e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 500 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 481 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 465 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>