More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0229 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0229  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 510 aa  1040    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.063419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0349  cysteinyl-tRNA synthetase  55.7 
 
 		 527 aa  558  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.348008  normal  0.382318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2381  cysteinyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 493 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1693  cysteinyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.508304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0590  cysteinyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.919384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0092  cysteinyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 492 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0131697  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5013  cysteinyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90332  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6692  cysteinyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1163  cysteinyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02459  cysteinyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 457 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0613  cysteinyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 480 aa  329  8e-89  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.618315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 785 aa  323  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1644  cysteinyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 494 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 481 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  37.05 
 
 		 483 aa  293  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 484 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 497 aa  284  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 470 aa  283  8.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 466 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 489 aa  279  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 499 aa  279  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0807  cysteinyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 504 aa  276  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0164  cysteinyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0618453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3992  cysteinyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 495 aa  273  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 490 aa  273  7e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 500 aa  272  9e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 474 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 500 aa  270  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 493 aa  269  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 486 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 465 aa  269  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 492 aa  267  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 457 aa  267  4e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 465 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 465 aa  266  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 465 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 465 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 465 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 465 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 465 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 465 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 467 aa  265  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 460 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 466 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  32.63 
 
 		 495 aa  264  3e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 460 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 486 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 492 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 495 aa  263  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 466 aa  263  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 460 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 460 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 497 aa  263  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  35.1 
 
 		 497 aa  262  8.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 486 aa  262  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 456 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 460 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 485 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 500 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 476 aa  260  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  34.63 
 
 		 487 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 474 aa  259  7e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 460 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 456 aa  259  9e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 499 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  34.5 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 484 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 478 aa  259  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 		 486 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 473 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 456 aa  256  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 475 aa  256  7e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>