More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6219 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6219  heat shock protein Hsp20  100 
 
 		 93 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  73.86 
 
 		 180 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  60.23 
 
 		 175 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  65.38 
 
 		 181 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  57.95 
 
 		 173 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  65.38 
 
 		 181 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  56.82 
 
 		 177 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  51.85 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  56.58 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  51.85 
 
 		 231 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  47.73 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  44.87 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  48 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  51.28 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  47.3 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2790  heat shock protein Hsp20  41.38 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000163808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  47.3 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  39.08 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  42.5 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  37.65 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  37.65 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  40.26 
 
 		 185 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  40.26 
 
 		 185 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  43.84 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2281  heat shock protein Hsp20  44.59 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.78764  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  45.45 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7808  Hsp20 family heat-shock protein  46.84 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00255696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  49.21 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  49.21 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  40 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  35.29 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  35.29 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  37.97 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  41.77 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  37.21 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  41.1 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  43.04 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0838  heat shock protein Hsp20  37.18 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2316  heat shock protein Hsp20  43.06 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0611291  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  42.25 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  38.75 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  41.77 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3080  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2796  heat shock protein  37.66 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300285  normal  0.746249 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  41.33 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  43.06 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1977  heat shock protein Hsp20  39.24 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.334288  normal  0.643075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2899  heat shock protein Hsp20  36.11 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0174584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  45.83 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2809  heat shock protein Hsp20  39.24 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0774  heat shock protein Hsp20  42.25 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1166  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.380039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  41.89 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2299  heat shock protein Hsp20  44.59 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0954  Hsp20/alpha crystallin family protein  33.33 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.154946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  39.51 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  39.51 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  40.28 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  33.72 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  39.47 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  34.18 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4816  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  36.25 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  43.06 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  43.06 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2022  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  37.33 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_825  HSP20/alpha crystallin  33.33 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  37.93 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0622  HSP20 family protein  43.08 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0513  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4230  heat shock protein Hsp20  38.2 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  37.84 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  39.19 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  38.2 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2678  HSP20 family protein  42.42 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  40.54 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  38.67 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  39.73 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6093  heat shock protein Hsp20  36.99 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>