62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2376 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  94.72 
 
 		 246 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  94.72 
 
 		 246 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  97.15 
 
 		 245 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  93.9 
 
 		 246 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  93.9 
 
 		 246 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  93.5 
 
 		 246 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  76.83 
 
 		 245 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  76.42 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  76.42 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  76.42 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  76.42 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  76.42 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  76.42 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  76.42 
 
 		 245 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  65.04 
 
 		 243 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  66.26 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  63.82 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  53.42 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  52.65 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  57.69 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  53.88 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  58.27 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  43.1 
 
 		 237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  40.74 
 
 		 239 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  42.67 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  41.35 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  39.34 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  39.13 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  39.9 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  38.83 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  37.44 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  36.36 
 
 		 224 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  34.47 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  33 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  32.35 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  32.35 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  40.57 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  34.45 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  30.52 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  30.52 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  30.05 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  34.03 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  32.11 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  30.33 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  34.1 
 
 		 224 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  27.63 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  28.92 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  30.39 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  29.13 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  27.59 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  49.21 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  24.76 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  30.53 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  28.85 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  21.81 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  21.81 
 
 		 220 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25.33 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2769  protein of unknown function DUF541  28.5 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  27.03 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>