52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2404 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  100 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  83.33 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  81.48 
 
 		 233 aa  257  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  64.81 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  69.23 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  58.27 
 
 		 246 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  58.27 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  54.93 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  55.17 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  57.48 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  51.63 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  57.48 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  52.35 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  57.48 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  56.69 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  56.06 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  56.06 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  56.06 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  56.06 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  56.06 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  56.06 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  56.06 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  56.03 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  37.6 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  33.6 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  36.59 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  33.85 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  35.88 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  35.33 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  34.4 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  36.15 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  34.4 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  34.97 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  32.8 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  32.31 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  32.31 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  31.2 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  31.2 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  28.95 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  31.2 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  30.47 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  36.94 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  30.72 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  27.52 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  36.31 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  34.75 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  30.13 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  23.39 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  28.17 
 
 		 244 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  33.94 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  27.42 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>