70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2712 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  79.49 
 
 		 241 aa  364  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  65.38 
 
 		 245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  62.29 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  62.29 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  59.55 
 
 		 239 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  57.77 
 
 		 289 aa  241  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  64.9 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  46.6 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  43.96 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  40.85 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  40.85 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  40.85 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  40.85 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  40.85 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  40.85 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  40.38 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  40.87 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  41.06 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  41.06 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  38.5 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  38.46 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  40.58 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  40.58 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  39.23 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  40.58 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  40.58 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  36.71 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  35.58 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  39.13 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  34.1 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  34.1 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  30.17 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  30.64 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  30.64 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  33.18 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  29.95 
 
 		 259 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  32.38 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  29.95 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  31.54 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  29.91 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  29.91 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  29.91 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  32.23 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  29.38 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  30.64 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  28.95 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  25.55 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  29.81 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.38 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  29.56 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  30.92 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  28.17 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  26.98 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  26.97 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  28.51 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  28.51 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  28.51 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  28.02 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  27.56 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  26.58 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  40.62 
 
 		 65 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  23.24 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  25.94 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  27.16 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  25.52 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5190  protein of unknown function DUF541  24.12 
 
 		 229 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>