65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3152 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  98.73 
 
 		 237 aa  467  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  76.82 
 
 		 239 aa  339  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  60.25 
 
 		 245 aa  297  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  63.25 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  62.15 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  64.25 
 
 		 289 aa  263  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  66.51 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  51.69 
 
 		 239 aa  224  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  51.92 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  39.83 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  39.39 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  43.06 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  38.3 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  42.45 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  43.75 
 
 		 246 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  39.52 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  41.98 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  41.98 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  41.98 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  41.98 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  39.62 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  41.98 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  41.98 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  41.52 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  40.95 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  41.01 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  41.51 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  40.27 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  39.48 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  40.55 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  40.55 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  34.04 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  34.04 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  33.97 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  33.49 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  33.06 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  32.62 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  36.94 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  31.48 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  31.48 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  31.48 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  31.48 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  32.18 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  30.48 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  25.78 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  29.92 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  27.2 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  29.13 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  26.03 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  27.65 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  45.9 
 
 		 65 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25.78 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.67 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25.4 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  25.58 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  27.04 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  25.31 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  25.3 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  24.09 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  24.09 
 
 		 234 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>