66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1585 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  477  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  75.32 
 
 
237 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  74.46 
 
 
237 aa  308  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  55.65 
 
 
245 aa  267  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  60.09 
 
 
241 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  58.4 
 
 
289 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  61.24 
 
 
235 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  62.21 
 
 
236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  48.08 
 
 
239 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  45.93 
 
 
224 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  38.86 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  38.01 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  39.91 
 
 
246 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  39.3 
 
 
246 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  38.97 
 
 
234 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  37.87 
 
 
233 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  37.87 
 
 
233 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  39.45 
 
 
246 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  39.45 
 
 
246 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  39.34 
 
 
229 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  39.72 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  39.21 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  39.45 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  39.72 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  39.72 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  39.72 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  39.72 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  39.72 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  39.72 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  38.79 
 
 
245 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  39.45 
 
 
245 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  39.34 
 
 
240 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  30.61 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  31.34 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  31.92 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  30.2 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  28.84 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  30 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  27.04 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  28.09 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  29.95 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  35.42 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  27.7 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  27.7 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  27.7 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  27.7 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  31.78 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  25.32 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  30.29 
 
 
241 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  26.51 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  26.78 
 
 
244 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  25.86 
 
 
224 aa  55.1  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  24.49 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  28.35 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  28.35 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  28.35 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  25.69 
 
 
251 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  25 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25.57 
 
 
245 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  23.79 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  27.4 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  30.32 
 
 
244 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  30.26 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>