62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2464 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  99.59 
 
 
246 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  99.59 
 
 
246 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  96.34 
 
 
246 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  97.15 
 
 
246 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  93.5 
 
 
246 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  93.5 
 
 
245 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  77.64 
 
 
245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  77.64 
 
 
245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  77.64 
 
 
245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  77.64 
 
 
245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  77.64 
 
 
245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  77.64 
 
 
245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  77.24 
 
 
245 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  77.24 
 
 
245 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  63.41 
 
 
243 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  68.75 
 
 
243 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  63.41 
 
 
240 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  54.55 
 
 
234 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  56.56 
 
 
233 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  52.26 
 
 
233 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  53.4 
 
 
229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  49.69 
 
 
221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  41.39 
 
 
245 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  40.99 
 
 
239 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  42.79 
 
 
235 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  40.58 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  42.67 
 
 
237 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  42.24 
 
 
237 aa  144  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  39.15 
 
 
289 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  38.73 
 
 
238 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  37.91 
 
 
239 aa  135  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  35.92 
 
 
237 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  36.24 
 
 
224 aa  125  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  32.84 
 
 
238 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  41.04 
 
 
236 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  32.93 
 
 
259 aa  115  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  30.99 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  30.99 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  33.76 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  30.52 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  31.15 
 
 
238 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  35.24 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  28.51 
 
 
232 aa  89.4  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  30.48 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  31.76 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  32.68 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  29.9 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  29.06 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  29.65 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  51.56 
 
 
65 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  25.24 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  29.94 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  23.83 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  29.03 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  23.83 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  26.49 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0855  hypothetical protein  31.85 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0590409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>