24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0855 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0855  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  441  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0590409  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  38.12 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  31.55 
 
 
243 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  31.31 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  33.85 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  32.78 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  33.15 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  32.22 
 
 
246 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  32.22 
 
 
246 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  33.87 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  31.98 
 
 
245 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  33.04 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  30.41 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  31.58 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  26.87 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2801  hypothetical protein  25.1 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  26.37 
 
 
233 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>