59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1031 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  99.59 
 
 
245 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  94.29 
 
 
245 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  78.05 
 
 
246 aa  349  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  77.24 
 
 
246 aa  345  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  82.13 
 
 
246 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  82.13 
 
 
246 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  76.42 
 
 
246 aa  340  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  81.64 
 
 
246 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  79.71 
 
 
245 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  69.51 
 
 
243 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  71.15 
 
 
243 aa  297  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  64.49 
 
 
240 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  55.77 
 
 
229 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  52.56 
 
 
234 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  53.14 
 
 
233 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  52.66 
 
 
233 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  53.37 
 
 
221 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  41.04 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  40.85 
 
 
235 aa  144  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  40.55 
 
 
245 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  39.72 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  39.71 
 
 
238 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  39.15 
 
 
289 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  40.87 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  41.51 
 
 
237 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  35.24 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  36.29 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  37.5 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  37.5 
 
 
237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  35.89 
 
 
236 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  36.49 
 
 
239 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  36.74 
 
 
224 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  34.8 
 
 
237 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  32.86 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  32.86 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  34.8 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  40.85 
 
 
236 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  33.05 
 
 
259 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  31.9 
 
 
238 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  32.54 
 
 
241 aa  99  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  29.76 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  30.62 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  31.71 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  30.05 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  26.6 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  28.64 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  25.26 
 
 
227 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  25.32 
 
 
247 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  28.37 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  28.03 
 
 
241 aa  45.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>