61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2154 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 241 aa  459  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  29.89 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  29.89 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  29.86 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  29.7 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  27.07 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  29.09 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  29.09 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0855  hypothetical protein  35.75 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0590409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  29.09 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  28.89 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  28.48 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  32.1 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  28.48 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  28.48 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  29.63 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  29.63 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  28.44 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  30.47 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  27.98 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  27.98 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  27.98 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  27.98 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  27.98 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  27.98 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  27.98 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  27.31 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  26.67 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  26.15 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  27.91 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  26.7 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  30.04 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  27.4 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  28.8 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  24.11 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  27.75 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  27.39 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  26.46 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  27.18 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  28.89 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  25.91 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0620  protein of unknown function DUF541  27.44 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.276272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  31.62 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  24.62 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  21.95 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  28.83 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  25.73 
 
 		 232 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  25.65 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  25.79 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  26.26 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2010  hypothetical protein  26.54 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.937275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3934  protein of unknown function DUF541  22.07 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  30.8 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  27.78 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  23.33 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  27.75 
 
 		 241 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  27.75 
 
 		 241 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  27.75 
 
 		 241 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2074  hypothetical protein  27.13 
 
 		 242 aa  42  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.223483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  28.84 
 
 		 276 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>