39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1029 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  82.82 
 
 		 225 aa  348  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  86.36 
 
 		 220 aa  347  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  29.74 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  29.23 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  30.5 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  28.96 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  28.42 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  26.34 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  26.04 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  25.73 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  25.73 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  26.15 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  27.18 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  25.46 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  28.63 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  24.88 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  25.24 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  26.71 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  26.26 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  25.26 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  25.26 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  25.26 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  25.26 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  25.26 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  25.26 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  25.26 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  24.77 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  23.96 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  31.06 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  23.35 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  23.35 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  26.42 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  23.35 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  25.12 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  25.6 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  31.37 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  26.58 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>