58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0846 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  70.78 
 
 		 237 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  71.76 
 
 		 237 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  65.27 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  64.02 
 
 		 236 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  67.91 
 
 		 238 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  63.6 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  67.44 
 
 		 238 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  67.44 
 
 		 238 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  66.51 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  63.33 
 
 		 236 aa  271  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  34.2 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  36.41 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  36.14 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  32.84 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  32.17 
 
 		 259 aa  124  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  32.35 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  34.8 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  34.8 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  34.8 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  34.8 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  34.8 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  34.8 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  30.95 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  34.31 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  34.31 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  34.13 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  30.88 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  32.35 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  32.35 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  31.03 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  32.76 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  31.86 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  33 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  31.86 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  31.86 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  30.88 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  33.48 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  34.48 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  31.39 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  33.05 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  32.64 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  32.23 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  29.95 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  28.81 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  30.09 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  29.06 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  32.8 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  30.05 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  26.29 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  27.83 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  23.92 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  29.74 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  30.43 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  24.87 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  27.13 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  27.13 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>