44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0325 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  26.7 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  26.34 
 
 		 259 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  25.64 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  26.7 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  22.82 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  22.82 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  22.82 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  23.7 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  23.41 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  24.46 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  21.84 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  23.22 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  23.85 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  23.92 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  28.99 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  28.5 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  28.5 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  22.27 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  28.5 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  28.02 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  28.02 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  27.09 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  27.23 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  26.6 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  26.6 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  26.6 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  26.6 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  27.04 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  26.6 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  26.6 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  27.55 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  28.1 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  21.99 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  26.19 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  25.62 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  24.35 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  24.35 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  25.38 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  22 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  24.75 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  21.64 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  21.05 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  21.5 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>