59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1666 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
233 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  48.28 
 
 
224 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  43.23 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  36.07 
 
 
238 aa  121  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  35.51 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  35.98 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  35.98 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  38.42 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  35.51 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  37.45 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  39.52 
 
 
236 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  34.48 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  37.02 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  33.5 
 
 
243 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  34.78 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  34.78 
 
 
237 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  33.62 
 
 
234 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  32.02 
 
 
240 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  33.96 
 
 
245 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  33.65 
 
 
246 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  30.08 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  32.86 
 
 
245 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  33.18 
 
 
246 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  33.18 
 
 
246 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  33.18 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  32.38 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  33.62 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  30.69 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  29.66 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  32.7 
 
 
246 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  33.65 
 
 
229 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  33.64 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  34.32 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  32.12 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  33.9 
 
 
237 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  92  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  30.8 
 
 
259 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  31.46 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  37.81 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  31.43 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  29.25 
 
 
289 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  32.62 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  31.55 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  31.88 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  25.37 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  28.57 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  28.34 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  27.27 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  26.67 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  27.83 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  26.82 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  33.14 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  24.83 
 
 
247 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>