60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2790 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  47.29 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  35.1 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  34.78 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  36.55 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  36.59 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  35.92 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  36.1 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  36.1 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  36.13 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  35.61 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  35.61 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  35.58 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  36.1 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  31.73 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  35.5 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  35.41 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  34.27 
 
 		 245 aa  98.2  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  30.92 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  30.1 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  29.61 
 
 		 246 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  29.61 
 
 		 246 aa  92  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  32.04 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  29.13 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  27.9 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  29.47 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  29.13 
 
 		 246 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  29.57 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  29.06 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  28.95 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  28.95 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  29.9 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  35.14 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  26.09 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  30.1 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  32.34 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  30.67 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  28.36 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  32 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  26.29 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  31.33 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  22.59 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  25.7 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  36.67 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  26.87 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  33.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  29.95 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  26.69 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  29.68 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  27.17 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  27.17 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  27.81 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>