26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3227 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  86.36 
 
 		 227 aa  331  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  32.22 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  28.51 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  25.79 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  25.26 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  26.73 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  29.94 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  29.38 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  27.23 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  27.13 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  26.73 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  24.47 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  24.35 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  24.35 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  22.08 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  22.87 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  21.8 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  23.83 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  21.81 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  29.65 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  31.07 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  24.23 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  22.96 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  23.9 
 
 		 241 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>