61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0312 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  36.06 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  36.41 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  35.1 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  35.1 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  33.62 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  36.6 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  34.47 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  34.47 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  43 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  37 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  37 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  34.95 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  31.51 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  31.88 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  31.68 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  31.68 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  30.2 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  27 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  31.22 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  35.5 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  28.86 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  28.86 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  29.76 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  32.04 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  28.02 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  30.69 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  27.56 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  27.54 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  27.54 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  26.67 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  26.75 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  28.08 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  28.16 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  25.11 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  27.45 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  30.15 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  26.8 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  24.75 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  28.17 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  25.47 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  26.51 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  32.6 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  32.42 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  26.52 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  29.38 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  26.67 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  31.18 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  23.39 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  30.38 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25.71 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  28.29 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  26.09 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  29.63 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>