54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0929 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  97.9 
 
 		 238 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  97.9 
 
 		 238 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  93.7 
 
 		 238 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  70.29 
 
 		 238 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  75.12 
 
 		 237 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  74.3 
 
 		 237 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  67.37 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  66.95 
 
 		 236 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  66.21 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  63.55 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  36.52 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  36.71 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  35.27 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  35.44 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  34.89 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  35.38 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  32.86 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  32.86 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  32.35 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  31.37 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  31.37 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  31.56 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  32 
 
 		 246 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  30.92 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  30.88 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  30.39 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  30.17 
 
 		 233 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  30.17 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  30.43 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  34.15 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  33.53 
 
 		 233 aa  98.6  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  31.44 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  29.33 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  30.99 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  30.99 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  31.51 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  30.56 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  30.88 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  22.41 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  31.37 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  30.19 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  28.05 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  27.23 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  27.63 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  28.64 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  23.44 
 
 		 227 aa  42  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>