67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1575 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  55.56 
 
 		 224 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  53.59 
 
 		 245 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  51.43 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  46.67 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  48.11 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  49.78 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  42.44 
 
 		 289 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  53.08 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  38.65 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  38.65 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  39.13 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  37.23 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  36.8 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  37.5 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  33.19 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  37.04 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  37.04 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  33.48 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  34.91 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  37.04 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  35.65 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  35.75 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  35.81 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  35.81 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  35.81 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  35.81 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  35.81 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  35.81 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  35.35 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  28.51 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  28.09 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  30.84 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  29.88 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  29.58 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  28.28 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  27.63 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  27.57 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  29.47 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  28.04 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  28.04 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  27.57 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  28 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  26.39 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  28.97 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  26.73 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  28.21 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  34.19 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  29.08 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  26.19 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  26.84 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  30.08 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  26.61 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  24.02 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  31.12 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  28.21 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  25.58 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  42.42 
 
 		 65 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  23.56 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  21.9 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  25.77 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  28.66 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  23.11 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  26.97 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>