58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2671 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  98.28 
 
 		 233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  65.97 
 
 		 234 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  62.98 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  81.48 
 
 		 221 aa  257  8e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  55.34 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  53 
 
 		 243 aa  223  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  56.37 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  57.07 
 
 		 246 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  55.86 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  55.12 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  56.1 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  56.1 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  56.1 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  55.61 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  53.14 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  53.14 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  53.14 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  53.14 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  53.14 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  53.14 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  53.14 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  53.62 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  38.56 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  38.12 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  40.26 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  39.83 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  37.61 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  34.09 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  35.65 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  33.82 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  33.64 
 
 		 235 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  33.91 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  34.76 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  33.91 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  33.02 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  33.48 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  32.87 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  32.68 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  31.82 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  31.78 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  36.27 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  30.58 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  29.95 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  32.34 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  30.92 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  30.92 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  28.5 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  70.77 
 
 		 65 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  26.19 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  29.56 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  26.96 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  28.27 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  24.35 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  25.21 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1463  hypothetical protein  21.89 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000388338  hitchhiker  0.000639516 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4429  protein of unknown function DUF541  22.33 
 
 		 242 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4493  protein of unknown function DUF541  22.33 
 
 		 242 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>