58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2793 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  76.07 
 
 		 234 aa  348  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  63.83 
 
 		 233 aa  284  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  62.55 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  56.59 
 
 		 240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  54.84 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  56.31 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  55.77 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  54.59 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  55.77 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  55.77 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  55.77 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  55.77 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  55.77 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  55.77 
 
 		 245 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  53.21 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  54.07 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  52.68 
 
 		 245 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  52.86 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  53.88 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  53.88 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  53.4 
 
 		 246 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  62.96 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  36.91 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  39.82 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  35.89 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  37.45 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  37.02 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  35.58 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  36.16 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  35.1 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  33.98 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  36.14 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  35.96 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  33.48 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  33.04 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  35.78 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  35.53 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  32.08 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  32.3 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  32.85 
 
 		 241 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  30.43 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  30.05 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  30.35 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  31.28 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  29.06 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  56.06 
 
 		 65 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  26.5 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  22 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  26.05 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  25.94 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  28.51 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  24.68 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>