61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2853 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  61.71 
 
 		 239 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  60.59 
 
 		 237 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  59.75 
 
 		 237 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  51.14 
 
 		 245 aa  244  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  54.5 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  57.77 
 
 		 235 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  56.12 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  45.15 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  45.45 
 
 		 224 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  39.08 
 
 		 233 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  38.66 
 
 		 233 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  37.61 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  39.91 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  39.53 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  36.55 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  39.53 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  39.53 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  39.53 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  39.53 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  39.53 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  39.53 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  38.74 
 
 		 246 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  37.62 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  37.99 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  37.78 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  37.14 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  37.14 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  36.65 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  38.1 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  40.55 
 
 		 240 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  33.97 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  32.34 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  31.91 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  28.24 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  29.95 
 
 		 241 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  27.31 
 
 		 238 aa  94  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  29.61 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  29.33 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  29.33 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  29.33 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  34.95 
 
 		 221 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  30.33 
 
 		 238 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  27.88 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  27.88 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  27.4 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  28.91 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  26.09 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  26.83 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  29.05 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  26.09 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  23.79 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  25.23 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  26.61 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  24.31 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  21.21 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  27.32 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  24 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2407  hypothetical protein  44.62 
 
 		 65 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  23.58 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2154  protein of unknown function DUF541  27.04 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.796553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>