71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2477 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2477  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0938  protein of unknown function DUF541  42.5 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.442407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0818  hypothetical protein  33.03 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4555  hypothetical protein  33.99 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.734774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4232  hypothetical protein  33 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12530  hypothetical protein  32.51 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.026062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0312  hypothetical protein  30.69 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0925  hypothetical protein  30.88 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0929  hypothetical protein  30.88 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0886  hypothetical protein  30.88 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58330  hypothetical protein  30.3 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4292  hypothetical protein  29.9 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5109  hypothetical protein  29.87 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0846  hypothetical protein  30.05 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1666  cyclic nucleotide-binding protein  36.5 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1896  hypothetical protein  28.99 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0542835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2545  hypothetical protein  29.9 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.470705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3631  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1643  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1031  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2955  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2331  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0325  hypothetical protein  26.92 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000791137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1183  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0680  hypothetical protein  30.05 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2218  hypothetical protein  28.64 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0991  protein of unknown function DUF541  29.95 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2213  protein of unknown function DUF541  27.45 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.903363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1575  hypothetical protein  29.08 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1024  hypothetical protein  29.56 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2671  protein of unknown function DUF541  26.96 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2712  hypothetical protein  29.56 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0375751  normal  0.0258251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2790  hypothetical protein  30.99 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0649  hypothetical protein  27.66 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0830  hypothetical protein  28.16 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2464  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1438  hypothetical protein  27.19 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0128713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1585  hypothetical protein  29.81 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0198328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2459  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1848  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0977  hypothetical protein  27.23 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21947  hitchhiker  0.000157604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2853  hypothetical protein  26.09 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0835  hypothetical protein  28.16 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2793  hypothetical protein  26.5 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5790  hypothetical protein  27.67 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1644  hypothetical protein  25.78 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25595 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2376  hypothetical protein  26.7 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2508  hypothetical protein  27.32 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2730  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.797514  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2499  protein of unknown function DUF541  28.64 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3152  hypothetical protein  28.16 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.900367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  24.88 
 
 		 242 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3301  hypothetical protein  29.03 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  29.03 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3304  hypothetical protein  29.03 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3227  hypothetical protein  29.03 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3406  hypothetical protein  29.03 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0610305  normal  0.0802765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02716  hypothetical protein  24.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1029  hypothetical protein  25.35 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0771  protein of unknown function DUF541  24.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4219  hypothetical protein  24.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3347  hypothetical protein  24.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02753  hypothetical protein  24.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3080  hypothetical protein  24.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3249  hypothetical protein  24.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3058  hypothetical protein  24.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.550977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0788  hypothetical protein  24.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2404  putative signal peptide protein  25.62 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3227  hypothetical protein  23.9 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2830  hypothetical protein  23.9 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.753635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2584  protein of unknown function DUF541  27.46 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0117421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>