23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2010 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2010  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  466  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.937275  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  29.24 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  27.42 
 
 
242 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  27.59 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  27.33 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  23.48 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  26.14 
 
 
240 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  25.57 
 
 
249 aa  48.9  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2220  hypothetical protein  24.89 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.932217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  25.59 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  24.64 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1457  protein of unknown function DUF541  22.94 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.660121  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  23.71 
 
 
238 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  28.18 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0864  hypothetical protein  30.71 
 
 
248 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0301002  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  26.29 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  25.82 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  24.85 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  26.03 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  25.93 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  25.63 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0620  protein of unknown function DUF541  25.33 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.276272 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  22.44 
 
 
229 aa  41.6  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>