More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1580 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1580  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  100 
 
 
284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0085  ABC transporter, permease protein  98.59 
 
 
284 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0130  ABC-type spermidine/putrescine transport system, permease component II  57.03 
 
 
293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  50.23 
 
 
262 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.67 
 
 
262 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
264 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2037  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  39.53 
 
 
269 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0287  ABC transporter permease  40.93 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.64 
 
 
266 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.102972 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
266 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2398  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit  41.35 
 
 
266 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.95 
 
 
264 aa  175  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
267 aa  172  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  37.93 
 
 
256 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  36.64 
 
 
256 aa  165  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  34.63 
 
 
266 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.1 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  34.1 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  34.1 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  34.1 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3072  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.25 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  33.85 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  39.73 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  39.29 
 
 
256 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
261 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  37.31 
 
 
285 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
261 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  38.26 
 
 
260 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  37.1 
 
 
260 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  38.1 
 
 
258 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  35.89 
 
 
273 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2805  ornithine carbamoyltransferase  35.68 
 
 
276 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
260 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8156  ABC transporter  39.75 
 
 
264 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  34.1 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.59 
 
 
267 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
272 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3038  ABC permidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
267 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
259 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420428  hitchhiker  0.000000201518 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
267 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.548577  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  35.08 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
269 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.682654  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
264 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0286  ornithine carbamoyltransferase  32.95 
 
 
297 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470057  normal  0.688264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5177  ornithine carbamoyltransferase  32.95 
 
 
297 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00577642  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.5 
 
 
273 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  33.6 
 
 
273 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
266 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5084  ornithine carbamoyltransferase  32.95 
 
 
297 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182213  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210176  normal  0.100236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5401  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.5 
 
 
296 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.424261  hitchhiker  0.00155673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  37.86 
 
 
286 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0985  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.14 
 
 
281 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.88 
 
 
256 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  33.6 
 
 
272 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
273 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2004  Ornithine carbamoyltransferase  36.1 
 
 
269 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  35.74 
 
 
288 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  38.64 
 
 
272 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5237  ornithine carbamoyltransferase  33.85 
 
 
297 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.51 
 
 
281 aa  149  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  36.84 
 
 
284 aa  149  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.1 
 
 
281 aa  148  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.1 
 
 
281 aa  148  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  36.91 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0395  polyamine transport protein PotI  34.25 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00609739  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03960  polyamine transport protein PotI  34.25 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
272 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1014  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.73 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0953  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.73 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1033  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.73 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4861  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.7 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  36.65 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01122  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.48 
 
 
264 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  32.48 
 
 
264 aa  146  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2201  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.48 
 
 
264 aa  146  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2479  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.48 
 
 
264 aa  146  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0237436  normal  0.58915 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.48 
 
 
264 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1244  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.48 
 
 
264 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2002  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.48 
 
 
264 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.818334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  32.48 
 
 
264 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.48 
 
 
264 aa  146  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.86 
 
 
270 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5301  putrescine ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0349  ornithine carbamoyltransferase  32.45 
 
 
295 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  35.5 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  38.06 
 
 
259 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  38.06 
 
 
259 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
272 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>