More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1355 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  54.13 
 
 		 1160 aa  797    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  54.13 
 
 		 1160 aa  797    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2402  DNA polymerase III subunit alpha  46.78 
 
 		 1163 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1206  DNA polymerase III subunit alpha  99.73 
 
 		 1174 aa  1529    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  47 
 
 		 1155 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  53.19 
 
 		 1174 aa  787    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2925  DNA polymerase III, alpha subunit  63.44 
 
 		 1173 aa  958    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.917555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1287  DNA polymerase III, alpha subunit  52.28 
 
 		 1158 aa  763    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  55.51 
 
 		 1165 aa  819    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3552  DNA polymerase III, alpha subunit  44.4 
 
 		 1217 aa  643    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.658792  hitchhiker  0.00874617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2205  DNA polymerase III subunit alpha  79.95 
 
 		 1173 aa  1254    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1197  DNA polymerase III subunit alpha  99.76 
 
 		 1274 aa  1726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  51.92 
 
 		 1186 aa  778    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  52.8 
 
 		 1164 aa  789    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  45.83 
 
 		 1163 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  53.87 
 
 		 1158 aa  816    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  52.01 
 
 		 1173 aa  777    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4484  DNA polymerase III, alpha subunit  61.55 
 
 		 1186 aa  929    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  62.88 
 
 		 1187 aa  991    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  53.24 
 
 		 1183 aa  753    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  99.87 
 
 		 1174 aa  1529    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  56.03 
 
 		 1148 aa  825    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  56.03 
 
 		 1148 aa  825    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  52.27 
 
 		 1173 aa  779    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  49.2 
 
 		 1247 aa  712    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710188 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  60.37 
 
 		 1156 aa  920    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  53.27 
 
 		 1176 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2534  DNA polymerase III subunit alpha  79.63 
 
 		 1175 aa  1210    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1496  DNA polymerase III subunit alpha  52.93 
 
 		 1157 aa  799    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  63.39 
 
 		 1141 aa  921    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  46.46 
 
 		 1168 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  54.13 
 
 		 1160 aa  797    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1355  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  100 
 
 		 1253 aa  2501    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.404824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  54.45 
 
 		 1158 aa  822    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  53.34 
 
 		 1173 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3775  DNA polymerase III subunit alpha  53.07 
 
 		 1162 aa  770    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  46.09 
 
 		 1156 aa  659    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  92.98 
 
 		 1176 aa  1421    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  46.13 
 
 		 1175 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0327  DNA polymerase III subunit alpha  99.87 
 
 		 1174 aa  1529    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03222  DNA polymerase III subunit alpha  53.41 
 
 		 1143 aa  772    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  54.58 
 
 		 1157 aa  820    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  46.28 
 
 		 1155 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  54.13 
 
 		 1160 aa  797    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  53.52 
 
 		 1158 aa  789    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  46.5 
 
 		 1157 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4522  DNA polymerase III subunit alpha  46.85 
 
 		 1173 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0819  DNA polymerase III subunit alpha  45.83 
 
 		 1163 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  53.73 
 
 		 1157 aa  808    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  64.45 
 
 		 1174 aa  978    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1232  DNA polymerase III, alpha subunit  49.4 
 
 		 1203 aa  714    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  47.52 
 
 		 1156 aa  641    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0984  DNA polymerase III subunit alpha  96.41 
 
 		 1278 aa  1523    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  45.05 
 
 		 1210 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  46.58 
 
 		 1151 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4171  DNA polymerase III subunit alpha  53.19 
 
 		 1174 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0606  DNA polymerase III, alpha subunit  68.69 
 
 		 1204 aa  1090    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  53.92 
 
 		 1157 aa  794    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  54.26 
 
 		 1160 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  62.33 
 
 		 1185 aa  932    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  51.14 
 
 		 1173 aa  768    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  47.04 
 
 		 1185 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  66.76 
 
 		 1149 aa  994    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2893  DNA polymerase III, alpha subunit  62.47 
 
 		 1190 aa  939    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.580471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  90.05 
 
 		 1193 aa  1404    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  53.85 
 
 		 1159 aa  813    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  46.32 
 
 		 1151 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  53.36 
 
 		 1168 aa  795    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  46.27 
 
 		 1168 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1214  DNA polymerase III, alpha subunit  49.07 
 
 		 1247 aa  713    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.69236  normal  0.734793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0754  DNA polymerase III subunit alpha  79.21 
 
 		 1176 aa  1234    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  48.87 
 
 		 1163 aa  733    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0921  DNA polymerase III subunit alpha  44.72 
 
 		 1165 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2870  DNA polymerase III subunit alpha  51.6 
 
 		 1177 aa  770    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.91064  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2252  DNA polymerase III, alpha subunit  64.42 
 
 		 1174 aa  976    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.353528  normal  0.94108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  93.93 
 
 		 1177 aa  1429    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  52.53 
 
 		 1157 aa  793    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  53.81 
 
 		 1155 aa  792    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  51.15 
 
 		 1143 aa  766    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  52.93 
 
 		 1158 aa  792    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  53.47 
 
 		 1158 aa  805    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  53.47 
 
 		 1158 aa  806    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  54.59 
 
 		 1182 aa  799    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  52.67 
 
 		 1158 aa  789    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  52.53 
 
 		 1160 aa  780    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1499  DNA polymerase III subunit alpha  54.02 
 
 		 1185 aa  801    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  92.71 
 
 		 1177 aa  1427    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  54.02 
 
 		 1173 aa  804    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  93.93 
 
 		 1177 aa  1429    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  52.67 
 
 		 1157 aa  794    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  47.96 
 
 		 1195 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  53.2 
 
 		 1158 aa  801    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  62.38 
 
 		 1190 aa  982    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0824  DNA polymerase III subunit alpha  99.87 
 
 		 1174 aa  1529    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  45.63 
 
 		 1184 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1044  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  99.36 
 
 		 1686 aa  2489    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3197  DNA polymerase III, alpha subunit  47.54 
 
 		 1139 aa  649    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  54.4 
 
 		 1157 aa  810    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  51.71 
 
 		 1173 aa  744    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  54.02 
 
 		 1162 aa  822    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>