More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2812 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 382 aa  762    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  80.21 
 
 		 379 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  63.69 
 
 		 383 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.44 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  62.3 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  57.07 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  57.18 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  57.72 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  57.56 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  58.33 
 
 		 379 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  58.29 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  55.16 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.25 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  56.64 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  55.95 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  52.45 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.05 
 
 		 363 aa  359  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  57.78 
 
 		 382 aa  347  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.9 
 
 		 379 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  55.15 
 
 		 353 aa  339  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  51.89 
 
 		 376 aa  339  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.59 
 
 		 368 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.35 
 
 		 362 aa  329  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.62 
 
 		 433 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.85 
 
 		 330 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.85 
 
 		 330 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.55 
 
 		 330 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  54.08 
 
 		 361 aa  322  8e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.85 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.79 
 
 		 328 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.27 
 
 		 618 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.53 
 
 		 368 aa  315  7e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  49.72 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  52.48 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.88 
 
 		 285 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.79 
 
 		 411 aa  256  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  35.88 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.03 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.33 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  34.65 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.9 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  38.64 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  33.9 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  34.37 
 
 		 383 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  33.67 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.87 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.69 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.7 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.75 
 
 		 390 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  32.73 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.31 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  28.32 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  33.16 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  33.93 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  32.29 
 
 		 388 aa  162  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.94 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  34.66 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.62 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.35 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.35 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  33.75 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  34.97 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  34.1 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  31.95 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  31.69 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  31.97 
 
 		 396 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  30.65 
 
 		 403 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  30.57 
 
 		 392 aa  156  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  32.2 
 
 		 382 aa  155  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.75 
 
 		 391 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  30.65 
 
 		 402 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  32.99 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.01 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  31.08 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  32.75 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  32.24 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  31.62 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  30.81 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  32.49 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  32.9 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  30.63 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  29.05 
 
 		 395 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 		 399 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  30.91 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  31.73 
 
 		 407 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  30.91 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  30.13 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  31.51 
 
 		 413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  32.12 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  30.73 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  30.81 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  31.36 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  32.41 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  30.81 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  31.41 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31.11 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  31.96 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  31.25 
 
 		 400 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  31.12 
 
 		 399 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>