More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1685 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 411 aa  828    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  44.11 
 
 		 379 aa  293  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  45.58 
 
 		 378 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  42.55 
 
 		 382 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  41.04 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  40.8 
 
 		 363 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  38.9 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.2 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  42.39 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.13 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  41.04 
 
 		 365 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  39.3 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.79 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  40.94 
 
 		 359 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  41.69 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  40.05 
 
 		 363 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  38.88 
 
 		 396 aa  250  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.85 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  39.41 
 
 		 376 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  40.2 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.95 
 
 		 368 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.95 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.93 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.38 
 
 		 362 aa  240  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.67 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.67 
 
 		 330 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.67 
 
 		 330 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  38.86 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  39.41 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  36.78 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.23 
 
 		 618 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.72 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.72 
 
 		 359 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.37 
 
 		 328 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  37.11 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.09 
 
 		 285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  34.36 
 
 		 361 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  26.68 
 
 		 402 aa  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  27.47 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  27.92 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  25.85 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  26.44 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  27.95 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  28.19 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  26.09 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  27.9 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  27.9 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  27.9 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  26.71 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  27.9 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  27.95 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  28.03 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  27.55 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  28.24 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  25.65 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  27.68 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  27.1 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  27.95 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  27.78 
 
 		 402 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  26.33 
 
 		 388 aa  133  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  26.25 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  27.27 
 
 		 384 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  27.95 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  27.1 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  25.66 
 
 		 388 aa  132  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  27.42 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  27.42 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  27.42 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  27.42 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  27.42 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  27.68 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  27.42 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  27.42 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  27.79 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  27.71 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  27.47 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  26.38 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  27.58 
 
 		 411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  27.58 
 
 		 411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  27.58 
 
 		 411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  27.45 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  26.13 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  25.36 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  25.18 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  24.94 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  27.99 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  24.82 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  27.08 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  26.09 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  26.84 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  26.13 
 
 		 414 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  26.02 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  26.49 
 
 		 418 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  27.25 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  25.38 
 
 		 385 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  26.82 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  26.01 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  25.78 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  25.78 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  25.9 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>