More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1193 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  69.68 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  69.42 
 
 		 363 aa  364  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.85 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.7 
 
 		 362 aa  358  5e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.59 
 
 		 330 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.59 
 
 		 330 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  67.52 
 
 		 359 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.47 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.49 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  65.09 
 
 		 376 aa  348  4e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  64.89 
 
 		 365 aa  348  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  65.02 
 
 		 359 aa  348  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  67.03 
 
 		 328 aa  346  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  68.1 
 
 		 359 aa  345  4e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  66.31 
 
 		 368 aa  345  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.91 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  61.62 
 
 		 353 aa  331  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64 
 
 		 368 aa  330  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  59.63 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  57.89 
 
 		 363 aa  305  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.87 
 
 		 433 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.82 
 
 		 618 aa  294  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  56.99 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  58.3 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  55.22 
 
 		 382 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.88 
 
 		 382 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.47 
 
 		 389 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  45.87 
 
 		 392 aa  258  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  55.56 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.17 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  53.31 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  52.55 
 
 		 379 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  50.53 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  51.37 
 
 		 382 aa  215  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.58 
 
 		 411 aa  189  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  39.72 
 
 		 361 aa  152  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  31.27 
 
 		 382 aa  148  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  37.85 
 
 		 405 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  36.03 
 
 		 391 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  29.57 
 
 		 386 aa  142  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  35.62 
 
 		 388 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.56 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.77 
 
 		 388 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  36.43 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  31.29 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  36.43 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.77 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  31.29 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  32.31 
 
 		 402 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  32.09 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.65 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  37.82 
 
 		 399 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  30 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  30.41 
 
 		 394 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  30.41 
 
 		 394 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  32.53 
 
 		 384 aa  129  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.01 
 
 		 385 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  31.99 
 
 		 400 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  35.57 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.06 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.38 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.8 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  31.62 
 
 		 388 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 407 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  32.78 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  34.48 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.89 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  34.32 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  28.28 
 
 		 376 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  32.08 
 
 		 413 aa  119  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.25 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  33.6 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  34.48 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.24 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  33.79 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  32.11 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  31.19 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  32.78 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  35.23 
 
 		 398 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  33.1 
 
 		 399 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  33.57 
 
 		 398 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  30.45 
 
 		 382 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  29.29 
 
 		 399 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  34.24 
 
 		 393 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  0.0000032787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  33.11 
 
 		 403 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  34.46 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  29.41 
 
 		 394 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  31.51 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  33.77 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  32.89 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  31.03 
 
 		 408 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  33.56 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  33.77 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  27.89 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  29.72 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  28.33 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  30.69 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  32.3 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>