More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1152 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  100 
 
 		 368 aa  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  73.42 
 
 		 376 aa  521  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  69.86 
 
 		 379 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  69.17 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  71.47 
 
 		 359 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  70.64 
 
 		 330 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  70.64 
 
 		 330 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  70.64 
 
 		 330 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.36 
 
 		 363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  63.89 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.7 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  61.52 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  60.83 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  60.89 
 
 		 363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  62.08 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  60.67 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.89 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  59.42 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.5 
 
 		 618 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.4 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.78 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.36 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  53.72 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  58.26 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  56.87 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.87 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  54.05 
 
 		 382 aa  346  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.63 
 
 		 379 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  54.8 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  56.25 
 
 		 378 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  52.34 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.71 
 
 		 285 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  49.86 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  48.56 
 
 		 392 aa  312  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  55.44 
 
 		 382 aa  302  7.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.95 
 
 		 411 aa  222  7e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  39.3 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  39.94 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  38.79 
 
 		 396 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.51 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  30.13 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.67 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  30.69 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  32.36 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  30.59 
 
 		 394 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  30.34 
 
 		 403 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  30.32 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  28.01 
 
 		 386 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.38 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  30.32 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  29.55 
 
 		 402 aa  157  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 		 382 aa  155  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  29.02 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  37.89 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.47 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  31.84 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  30.59 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  35.34 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  32.1 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  30.61 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.84 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.1 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 		 401 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  31.59 
 
 		 403 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.84 
 
 		 388 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  29.52 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.02 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  30.56 
 
 		 407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  30.79 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3411  aminotransferase  30.71 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  32.7 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  30.81 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  30.97 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  32.66 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.44 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  30.53 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  31.96 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  30.79 
 
 		 405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.74 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.31 
 
 		 392 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3284  aminotransferase  30.45 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.081713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3995  aminotransferase  31.4 
 
 		 406 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  32.91 
 
 		 398 aa  146  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3091  aminotransferase  30.45 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  33.16 
 
 		 396 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  30.05 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  32.32 
 
 		 402 aa  145  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  30.63 
 
 		 402 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.35 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  30.53 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  29.82 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  33.42 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1905  aspartate aminotransferase  28.64 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  34.63 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2123  aminotransferase class I and II  32.03 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00510874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2213  aminotransferase class I and II  31.95 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.13 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  30.26 
 
 		 425 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  31.94 
 
 		 407 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>