More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4029 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 330 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  99.09 
 
 		 330 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 330 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  81.96 
 
 		 379 aa  529  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  83.74 
 
 		 359 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  80.37 
 
 		 362 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  71.25 
 
 		 376 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  70.44 
 
 		 368 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  69.33 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  66.87 
 
 		 363 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.85 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.36 
 
 		 368 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  65.55 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  65.64 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  62.2 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  63.5 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  63.3 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.35 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  62.77 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.16 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.7 
 
 		 389 aa  347  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.59 
 
 		 285 aa  342  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.4 
 
 		 433 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  59.82 
 
 		 361 aa  338  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.33 
 
 		 618 aa  335  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  56.98 
 
 		 382 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  55.12 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.85 
 
 		 382 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  56.6 
 
 		 378 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.93 
 
 		 379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  57.19 
 
 		 373 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  56.44 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  54.22 
 
 		 383 aa  295  7e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  48.31 
 
 		 392 aa  282  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  58.48 
 
 		 382 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.97 
 
 		 411 aa  217  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  39.08 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.16 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  39.16 
 
 		 396 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  38.55 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  36.83 
 
 		 398 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  39.5 
 
 		 361 aa  154  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.82 
 
 		 405 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  35.71 
 
 		 398 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  35.31 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  34.9 
 
 		 397 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  35.49 
 
 		 400 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  35.82 
 
 		 399 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  36.31 
 
 		 409 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  34.73 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  30.79 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  33.63 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  30.79 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.9 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.9 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  31.36 
 
 		 382 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  27.65 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  31.41 
 
 		 409 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  30 
 
 		 400 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  31.2 
 
 		 391 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  32.44 
 
 		 407 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  30.55 
 
 		 395 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  29.85 
 
 		 386 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  32.94 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  31.3 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  31.25 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  33.13 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  30.92 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2213  aminotransferase class I and II  34.21 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  31.36 
 
 		 407 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.98 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  28.82 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1724  aminotransferase  34.5 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  32.28 
 
 		 407 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  33.81 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  30.64 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  30.64 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  32.1 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  30.64 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  32.1 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  30.64 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  32.1 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  30.64 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  31.61 
 
 		 411 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  32.21 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.48 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  30.64 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  30.64 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  35.4 
 
 		 400 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  35.89 
 
 		 417 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2123  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00510874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  30.23 
 
 		 392 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  30.88 
 
 		 412 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  35.14 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  33.53 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31 
 
 		 411 aa  136  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  34.12 
 
 		 391 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  30.34 
 
 		 402 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>