More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4306 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 353 aa  699    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.5 
 
 		 379 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.68 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  63.64 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.86 
 
 		 370 aa  411  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  60.74 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  61.83 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.85 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  63.43 
 
 		 368 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  60.68 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.32 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  62.18 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.77 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.46 
 
 		 330 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.77 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.65 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  59.21 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  61.99 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.77 
 
 		 368 aa  364  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.84 
 
 		 433 aa  353  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  58.17 
 
 		 382 aa  353  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.88 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.15 
 
 		 382 aa  348  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.1 
 
 		 618 aa  346  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.15 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.84 
 
 		 389 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  56.06 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.62 
 
 		 285 aa  335  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  53.17 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  56.01 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  56.53 
 
 		 373 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  56.86 
 
 		 378 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  56.32 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  47.57 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  52.33 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.11 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  39.76 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  37.74 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  39.55 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  34.4 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  32.61 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  39 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  32.61 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 		 361 aa  176  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.55 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  33.42 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  33.33 
 
 		 402 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.7 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  32.71 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  35.71 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  34.72 
 
 		 397 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  28.9 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  34.17 
 
 		 399 aa  162  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  31.54 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  33.6 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.43 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  33.24 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  34.62 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 398 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  33.06 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  33.24 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  33.24 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  32.88 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.52 
 
 		 388 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  33.24 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.7 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  32.61 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  32.79 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  32.14 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  32.04 
 
 		 400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.83 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  32.78 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  31.28 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  33.06 
 
 		 398 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  30.14 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  31.51 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  32.62 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  32.79 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1724  aminotransferase  34.07 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  31.69 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  30.62 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  33.52 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  32.79 
 
 		 412 aa  142  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  32.52 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  32.52 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  32.52 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  32.52 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  32.52 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2123  aminotransferase class I and II  33.88 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00510874  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  32.52 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  31.75 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2213  aminotransferase class I and II  33.79 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  28.82 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.01 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  31 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  31.01 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  31.61 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  32.25 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  31.34 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>