More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3758 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 368 aa  722    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  92.08 
 
 		 368 aa  626  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  66.03 
 
 		 368 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.5 
 
 		 370 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  63.36 
 
 		 365 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.91 
 
 		 379 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  63.76 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  64.15 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  62.6 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.71 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.97 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  60.77 
 
 		 376 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.35 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.35 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.35 
 
 		 330 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  64.89 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.41 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  59.83 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  60.94 
 
 		 363 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.89 
 
 		 618 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  62.21 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.61 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.69 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  55.68 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.07 
 
 		 389 aa  355  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.05 
 
 		 382 aa  341  9e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64 
 
 		 285 aa  338  9e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  56.03 
 
 		 382 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  55.74 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.7 
 
 		 379 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  55.07 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  55.97 
 
 		 379 aa  328  9e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  56.37 
 
 		 378 aa  325  6e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 392 aa  315  6e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  56.88 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.95 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  39.53 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  39.82 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.53 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  31.2 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  34.21 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  28.3 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  35.43 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  34.9 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  34.34 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  35.28 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  36.3 
 
 		 397 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  34.07 
 
 		 398 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  33.61 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  33.79 
 
 		 399 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  33.79 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  32.88 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.18 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  33.97 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  34.71 
 
 		 400 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.87 
 
 		 388 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  29.17 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  35.17 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  35.42 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  31.13 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  34.62 
 
 		 398 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  32.47 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1938  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 		 388 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.95 
 
 		 389 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.92 
 
 		 388 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  34.69 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 		 382 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  34.16 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.26 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  31.3 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.05 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  33.01 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  30.32 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  36.45 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  32.26 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 		 391 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  31.79 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  33.16 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  34.69 
 
 		 400 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  28.65 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  31.99 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  30.16 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  30.21 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  34.34 
 
 		 396 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.63 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  32.42 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  29.54 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  33.5 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  32.32 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  29.18 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  34.47 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  31.32 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  32.67 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  37.87 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  37.87 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  32.27 
 
 		 402 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>