More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0044 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  100 
 
 
405 aa  841    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  53.69 
 
 
398 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  53.44 
 
 
398 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  51.91 
 
 
399 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  52.54 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  53.16 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  52.42 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  52.38 
 
 
398 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  51.4 
 
 
397 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  52.39 
 
 
402 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  52.51 
 
 
401 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  51.65 
 
 
397 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  51.28 
 
 
399 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  52.79 
 
 
399 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  52.39 
 
 
402 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  51 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  52.01 
 
 
396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  51.4 
 
 
398 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  50.5 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  50.75 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  48.38 
 
 
407 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  47.3 
 
 
408 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  48.77 
 
 
409 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  48.76 
 
 
400 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  48.38 
 
 
397 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  46.12 
 
 
412 aa  378  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  47.52 
 
 
396 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  48.36 
 
 
396 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  52.01 
 
 
397 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  45.66 
 
 
395 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  49.01 
 
 
407 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  48.14 
 
 
399 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  48.14 
 
 
399 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  47.37 
 
 
401 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  46.67 
 
 
402 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  47.64 
 
 
409 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  46.65 
 
 
400 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  47.76 
 
 
398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  48.02 
 
 
417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  46.96 
 
 
405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  46.68 
 
 
405 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  47.55 
 
 
410 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  43.35 
 
 
409 aa  358  7e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  47.55 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  47.55 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  47.55 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  46.91 
 
 
403 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  48.13 
 
 
410 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  45.5 
 
 
405 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  46.34 
 
 
420 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  47.2 
 
 
420 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  46.15 
 
 
404 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  47.09 
 
 
399 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  45.91 
 
 
404 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  44.85 
 
 
434 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  46.67 
 
 
399 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  48.28 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  48.28 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  48.28 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  48.28 
 
 
410 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  48.03 
 
 
410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  48.03 
 
 
415 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  47.85 
 
 
406 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  47.85 
 
 
401 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  47.79 
 
 
387 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  46.17 
 
 
410 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  43.83 
 
 
398 aa  312  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1301  aminotransferase class I and II  42.75 
 
 
413 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.54822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2899  aminotransferase, class I and II  41.98 
 
 
392 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24547  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0759  hypothetical protein  42.38 
 
 
378 aa  291  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  41.73 
 
 
392 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2672  aminotransferase, class I and II  42.68 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  40.97 
 
 
392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  40.97 
 
 
392 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  44.35 
 
 
393 aa  280  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  0.0000032787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0427  aminotransferase  40.15 
 
 
393 aa  276  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  38.27 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  40.83 
 
 
460 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  40.77 
 
 
423 aa  264  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0275  aminotransferase, class I and II  40.55 
 
 
438 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  40.62 
 
 
423 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  37.18 
 
 
404 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0281  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0769639  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0376  aminotransferase, class I and II  41.28 
 
 
420 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0445  aminotransferase, class I and II  40.15 
 
 
412 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 
386 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1842  aminotransferase class I and II  37.12 
 
 
416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.134959  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.53 
 
 
405 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  34.9 
 
 
388 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  33.7 
 
 
396 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  33.42 
 
 
383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.48 
 
 
389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 
396 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.6 
 
 
391 aa  186  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.43 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  31.23 
 
 
390 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.33 
 
 
390 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  30.81 
 
 
384 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.51 
 
 
388 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.92 
 
 
391 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>