More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4528 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 359 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  89.27 
 
 		 379 aa  624  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  81.07 
 
 		 362 aa  556  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  83.44 
 
 		 330 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  83.74 
 
 		 330 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  83.74 
 
 		 330 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  73.16 
 
 		 376 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  70.42 
 
 		 363 aa  481  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  71.39 
 
 		 368 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  67.41 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  67.23 
 
 		 363 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  68.27 
 
 		 359 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  64.07 
 
 		 365 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  65.45 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  66.76 
 
 		 368 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  64.87 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.01 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  63.85 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.41 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.08 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.61 
 
 		 618 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.82 
 
 		 433 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  65.73 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  62.25 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  58.11 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  68.1 
 
 		 285 aa  358  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  59.5 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  57.22 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  58.52 
 
 		 379 aa  351  8.999999999999999e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  59.73 
 
 		 378 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.15 
 
 		 379 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  56.79 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.85 
 
 		 382 aa  338  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  50.91 
 
 		 392 aa  325  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  58.99 
 
 		 382 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  37.47 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  40.71 
 
 		 388 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.29 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  30.03 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  31.72 
 
 		 393 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  33.25 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  31.55 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  32.61 
 
 		 382 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  31.28 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  31.28 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  31.02 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  31.28 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  31.28 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  31.28 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  31.02 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  31.28 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  31.55 
 
 		 407 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  31.02 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  27.39 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  31.28 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  34.91 
 
 		 400 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  30.75 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  31.02 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  31.55 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  32.35 
 
 		 391 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  31.28 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  31.2 
 
 		 418 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  31.28 
 
 		 411 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31.28 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  31.47 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  34.97 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  31.02 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.91 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.75 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  35.88 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  31.3 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  31.3 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  31.28 
 
 		 411 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  38.7 
 
 		 361 aa  152  7e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  31.18 
 
 		 403 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  31.02 
 
 		 413 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  31.02 
 
 		 413 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  32.23 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  30.93 
 
 		 403 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  30.48 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  31.23 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  33.51 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  32.9 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  30.62 
 
 		 402 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  30.48 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  34.76 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  30.59 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  32.99 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>