More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0971 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  100 
 
 
379 aa  720    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  70.56 
 
 
378 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  59.59 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  64.8 
 
 
383 aa  409  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  61.66 
 
 
382 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.22 
 
 
382 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.07 
 
 
389 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  60.16 
 
 
365 aa  378  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  65.24 
 
 
382 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.18 
 
 
379 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.17 
 
 
370 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  58.95 
 
 
363 aa  362  8e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  58.29 
 
 
359 aa  359  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  58.17 
 
 
368 aa  359  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  57.99 
 
 
363 aa  357  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.18 
 
 
379 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  56.75 
 
 
376 aa  349  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  57.46 
 
 
359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  54.96 
 
 
396 aa  341  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.75 
 
 
362 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.92 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  55.37 
 
 
353 aa  322  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  54.78 
 
 
368 aa  322  9.000000000000001e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.29 
 
 
359 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.79 
 
 
368 aa  320  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.97 
 
 
330 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.68 
 
 
330 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.68 
 
 
330 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  53.31 
 
 
361 aa  301  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.41 
 
 
433 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.91 
 
 
618 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.26 
 
 
328 aa  296  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.12 
 
 
368 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  43.66 
 
 
411 aa  288  9e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  53.42 
 
 
373 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.3 
 
 
285 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  42.07 
 
 
388 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  41.33 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  40.17 
 
 
396 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.35 
 
 
383 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  41.55 
 
 
361 aa  178  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  34.13 
 
 
382 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  32.47 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 
392 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  33.77 
 
 
403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  33.85 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  32.19 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.98 
 
 
388 aa  162  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
394 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
394 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.72 
 
 
388 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.88 
 
 
405 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  36.83 
 
 
400 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.19 
 
 
388 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  33.68 
 
 
384 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  34.25 
 
 
400 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.93 
 
 
392 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  32.99 
 
 
407 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  34.53 
 
 
398 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  33.76 
 
 
397 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.54 
 
 
385 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  35.53 
 
 
399 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  32.53 
 
 
413 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  33.68 
 
 
397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  34.18 
 
 
398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.06 
 
 
387 aa  156  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  26.53 
 
 
386 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  30.05 
 
 
395 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31.76 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  32 
 
 
413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  29.47 
 
 
404 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  28.68 
 
 
398 aa  153  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  31.32 
 
 
421 aa  153  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  31.54 
 
 
408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  32.7 
 
 
393 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  32.7 
 
 
393 aa  152  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  32.66 
 
 
399 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  32.33 
 
 
399 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  30.97 
 
 
411 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  31.76 
 
 
411 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  30.97 
 
 
411 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  30.97 
 
 
411 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  33.42 
 
 
398 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  31.2 
 
 
411 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  32.03 
 
 
400 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1263  aspartate aminotransferase  29.57 
 
 
425 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  33.67 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.5 
 
 
385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  30.53 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  32.28 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  30.71 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.22 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  31.05 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1203  aspartate aminotransferase  29.82 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0124735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  35.09 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.4 
 
 
391 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  34.41 
 
 
396 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  32.29 
 
 
384 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  30.79 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0186  aspartate aminotransferase  29.56 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>