More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0872 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 618 aa  1216    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  85.52 
 
 		 433 aa  597  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  65.37 
 
 		 365 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  65.46 
 
 		 359 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  66.02 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  64.61 
 
 		 359 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.43 
 
 		 370 aa  412  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.62 
 
 		 379 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  61.41 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  61.84 
 
 		 368 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.45 
 
 		 363 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.22 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  61.14 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  59.78 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  58.38 
 
 		 376 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.61 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.22 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.89 
 
 		 368 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.58 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.33 
 
 		 330 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.33 
 
 		 330 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.02 
 
 		 330 aa  360  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.6 
 
 		 389 aa  359  8e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  59.17 
 
 		 373 aa  359  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  56.03 
 
 		 396 aa  358  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  59.03 
 
 		 382 aa  357  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  57.1 
 
 		 353 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  57.1 
 
 		 378 aa  339  7e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.27 
 
 		 382 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.35 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  51.65 
 
 		 383 aa  322  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  54.42 
 
 		 379 aa  317  6e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  57.64 
 
 		 382 aa  317  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.82 
 
 		 285 aa  310  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  48.17 
 
 		 392 aa  309  9e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.73 
 
 		 411 aa  228  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  41.84 
 
 		 388 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  40.95 
 
 		 396 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  40.65 
 
 		 396 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.95 
 
 		 383 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  40.4 
 
 		 361 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  34.13 
 
 		 382 aa  181  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  34.17 
 
 		 402 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  33.5 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  34.07 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  34.44 
 
 		 398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  31.56 
 
 		 402 aa  164  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  34.38 
 
 		 399 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  34.84 
 
 		 409 aa  164  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  36.16 
 
 		 405 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  34.38 
 
 		 399 aa  164  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  33.24 
 
 		 417 aa  164  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.81 
 
 		 388 aa  163  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  34.39 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  32.72 
 
 		 409 aa  162  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.73 
 
 		 388 aa  161  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  31.85 
 
 		 384 aa  160  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  32.63 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  29.6 
 
 		 384 aa  159  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  31.3 
 
 		 396 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.05 
 
 		 403 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  33.51 
 
 		 412 aa  158  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  31.3 
 
 		 392 aa  158  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  34.71 
 
 		 397 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  33.24 
 
 		 398 aa  157  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  33.16 
 
 		 400 aa  157  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  34.94 
 
 		 399 aa  157  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  35.19 
 
 		 397 aa  156  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  30.95 
 
 		 394 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  33.61 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.46 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  31.22 
 
 		 394 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  33.8 
 
 		 397 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  32.97 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  32.97 
 
 		 399 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  33.81 
 
 		 399 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  33.06 
 
 		 398 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  31.2 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  33.51 
 
 		 402 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  31.55 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  31.93 
 
 		 413 aa  153  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  31.66 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  31.12 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  31.12 
 
 		 402 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  33.06 
 
 		 398 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  27.3 
 
 		 386 aa  152  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  33.42 
 
 		 396 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 		 376 aa  152  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  32.7 
 
 		 401 aa  152  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  30.85 
 
 		 402 aa  151  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  34.88 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  31.85 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  31.38 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  30.93 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  33.51 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.65 
 
 		 387 aa  150  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31.66 
 
 		 411 aa  150  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  31.12 
 
 		 402 aa  150  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  30.4 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  32.89 
 
 		 410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>