More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3857 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 433 aa  855    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  85.48 
 
 		 618 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  66.94 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  67.4 
 
 		 363 aa  435  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  64.8 
 
 		 359 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  64.72 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.36 
 
 		 370 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  62.78 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.81 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  61.97 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.4 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.78 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  60 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.82 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  57.3 
 
 		 376 aa  378  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.17 
 
 		 362 aa  378  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  58.5 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.4 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.4 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.61 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.67 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  55.5 
 
 		 396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  59.72 
 
 		 373 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  58.84 
 
 		 353 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.56 
 
 		 389 aa  359  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.58 
 
 		 328 aa  358  8e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  57.95 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  51.62 
 
 		 382 aa  348  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  57.77 
 
 		 378 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.26 
 
 		 379 aa  338  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  50.68 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  53.76 
 
 		 379 aa  317  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  57.91 
 
 		 382 aa  315  8e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.87 
 
 		 285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  36.72 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  39.63 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  40.65 
 
 		 396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  40.95 
 
 		 396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.95 
 
 		 383 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  41.03 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  34.76 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.51 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  32.74 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  34.35 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  33.51 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 417 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  31.43 
 
 		 402 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  32.64 
 
 		 412 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  34.22 
 
 		 398 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  32.89 
 
 		 409 aa  169  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  34.57 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  34.57 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  34.97 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  34.77 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  32.39 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.17 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  32.2 
 
 		 384 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  31.43 
 
 		 392 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  32.7 
 
 		 396 aa  163  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  30.79 
 
 		 384 aa  162  9e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  35.2 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  31.59 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  34.37 
 
 		 399 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  34.79 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  36.25 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  28.73 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  34.15 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  31.96 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  35.65 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  32.21 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  31.7 
 
 		 402 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.46 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.81 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  32.43 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  32.98 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  32.49 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  36.53 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  33.86 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  33.88 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  31.7 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  31.46 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  33.59 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.28 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  31.98 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  31.19 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  32.59 
 
 		 397 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  34.52 
 
 		 398 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  32.72 
 
 		 434 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  31.69 
 
 		 413 aa  156  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  30.85 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  32.98 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  31.27 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  31.75 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  30.32 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  29.46 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  31.69 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  31.09 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  31.43 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  32.58 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>