More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1139 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 389 aa  754    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  64.61 
 
 		 365 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  67.2 
 
 		 378 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.44 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.27 
 
 		 379 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.21 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.3 
 
 		 363 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  61.27 
 
 		 376 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  62.01 
 
 		 396 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.76 
 
 		 379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  61.35 
 
 		 363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  62.33 
 
 		 382 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  63.54 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.79 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  61.11 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  61.83 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  60.27 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  58.81 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  59.46 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  65.97 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  61.08 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  55.27 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  57.45 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.7 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.7 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.82 
 
 		 368 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.41 
 
 		 330 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  58.6 
 
 		 618 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.56 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  55.87 
 
 		 353 aa  349  4e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.57 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  56.3 
 
 		 361 aa  332  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.78 
 
 		 328 aa  331  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  58.02 
 
 		 373 aa  325  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.47 
 
 		 285 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.94 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  31.84 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  35.68 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  33.92 
 
 		 399 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  34.99 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  34.73 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  35.42 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  31.82 
 
 		 392 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  32.82 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  35.25 
 
 		 398 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  35.28 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  26.94 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  31.46 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  34.38 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  31.2 
 
 		 394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  34.38 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2123  aminotransferase class I and II  37.12 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00510874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  32.32 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.56 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.82 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  33.66 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1724  aminotransferase  37.15 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2213  aminotransferase class I and II  37.15 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.72 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  30.46 
 
 		 402 aa  160  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  34.51 
 
 		 398 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  34.46 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  33.24 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  36 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  33.16 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  32.91 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.08 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  33.33 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  33.16 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  33.08 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.03 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  33.08 
 
 		 412 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 		 412 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  33.08 
 
 		 412 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  33.08 
 
 		 412 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  32.7 
 
 		 399 aa  155  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  33.08 
 
 		 412 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  36.34 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  32.48 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  33.08 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  32.48 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  33.16 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  32.48 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  34.1 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  36.06 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  32.89 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  32.91 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  32.91 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.61 
 
 		 388 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  32.82 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  32.82 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  32.82 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  32.82 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  32.63 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  34.74 
 
 		 401 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  32.49 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>