More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1002 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 386 aa  789    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  47.67 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  43.26 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  43.26 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  43.01 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  37.24 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.63 
 
 		 387 aa  256  3e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.36 
 
 		 388 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.34 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.14 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.76 
 
 		 385 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.85 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  35.84 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.95 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.5 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  34.52 
 
 		 407 aa  235  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  37.31 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  33.68 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  34.72 
 
 		 382 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  33.85 
 
 		 402 aa  233  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  33.08 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  35.05 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  33.08 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.51 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  31.73 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  34.9 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.93 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  33 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  36.67 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.88 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  33.85 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  33.67 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  32.84 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.88 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  31.71 
 
 		 399 aa  226  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.46 
 
 		 392 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  33.76 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  34.63 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.68 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  33.16 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  33.67 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  32.64 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  33.67 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  33.42 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  32.14 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  31.65 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  31.84 
 
 		 409 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  33.5 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  34.53 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  32.56 
 
 		 382 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  33.5 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  34.18 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  32.64 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  32.64 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  32.82 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  32.74 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  30.87 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  34.02 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  32.49 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  30.15 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  31.14 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  31.55 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  31.14 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  32.57 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  30.9 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  35.23 
 
 		 401 aa  209  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  32.83 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  31.22 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  31.65 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  33.16 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  32.65 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  30.9 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  32.9 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  30.33 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  31.33 
 
 		 401 aa  206  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  32.4 
 
 		 397 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.64 
 
 		 390 aa  205  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  31.16 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  30.3 
 
 		 397 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  29.23 
 
 		 397 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  31.74 
 
 		 410 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  31.71 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  30.3 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  30.85 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  29.7 
 
 		 405 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  31.23 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  31.23 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  31.23 
 
 		 410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  30.58 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  31.23 
 
 		 410 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  29.78 
 
 		 409 aa  195  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  29.52 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  31.19 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  30.85 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  32.52 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  29.82 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  29.82 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  30.59 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>