More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4140 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4140  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 368 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867426  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3758  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  92.08 
 
 		 368 aa  597  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  66.94 
 
 		 368 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.78 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2171  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.54 
 
 		 379 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.881952  normal  0.0135925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  64.61 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7962  aminotransferase class I and II  63.16 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  62.92 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  63.71 
 
 		 363 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06260  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  63.54 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11203  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  62.33 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3320  succinyldiaminopimelate transaminase  61.05 
 
 		 376 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.399623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4104  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.36 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4029  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.36 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4259  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.26 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4528  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.01 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5502  aminotransferase class I and II  64.53 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0771  aminotransferase class I and II  61.11 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1152  succinyldiaminopimelate transaminase  59.56 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.240594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0872  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.22 
 
 		 618 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1855  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.62 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.867359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3857  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  60.78 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.947972  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4306  aminotransferase class I and II  61.7 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.643765  normal  0.931768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1139  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.82 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  55.23 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2812  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.59 
 
 		 382 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1129  aminotransferase class I and II  56.99 
 
 		 382 aa  345  7e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1193  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  64.49 
 
 		 285 aa  342  7e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2532  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.53 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15500  aminotransferase  55.37 
 
 		 383 aa  339  5e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.694902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1088  succinyldiaminopimelate transaminase  56.2 
 
 		 373 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0971  aminotransferase class I and II  57.1 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26000  aminotransferase  57.38 
 
 		 378 aa  335  9e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0802  aminotransferase class I and II  51.3 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0994  succinyldiaminopimelate transaminase  58.18 
 
 		 382 aa  315  9e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  normal  0.844482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1685  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.95 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  40.59 
 
 		 388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0659  aminotransferase class I and II  41.6 
 
 		 361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  38.87 
 
 		 396 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  38.61 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  36.34 
 
 		 405 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  35.81 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  36.42 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  31.12 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  37.29 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  34.7 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.61 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  33.96 
 
 		 398 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  35.44 
 
 		 409 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  32.69 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  39.26 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  33.79 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  33.68 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  35.53 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  32.42 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  32.05 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.71 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  35.34 
 
 		 399 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  35.17 
 
 		 399 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  32.5 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  32.24 
 
 		 395 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  32.88 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.95 
 
 		 389 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  33.79 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  30.87 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  33.79 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  32.9 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  31.65 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  30.42 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.03 
 
 		 388 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  30.42 
 
 		 394 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.87 
 
 		 388 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  32.87 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  33.05 
 
 		 407 aa  145  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  31.64 
 
 		 409 aa  145  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  32.49 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  36 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  35.67 
 
 		 399 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  30.56 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  32.7 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  32.7 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  34.67 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  31.04 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  29.24 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  32.49 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  32.26 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  29.74 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  30.05 
 
 		 400 aa  142  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  32.36 
 
 		 402 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  30.59 
 
 		 391 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  30.2 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  34.34 
 
 		 410 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  33.59 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  31.03 
 
 		 413 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  28.99 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  33.81 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  33.52 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  35.31 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>